土壤不利于微生物存活：果园多年不施有机肥和浅施无机肥，造成土壤板结，存氧量差，根系生长缓慢，微生物菌肥哪家好，土壤pH值发生变化。在土壤中的残留直接*了土壤的团粒结构，使土壤中的微生物*。果园施用有机菌肥后，土壤中没有足够的微生物使菌肥发酵繁衍而形成有效的菌群，阻碍了肥效的发挥。

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与生物菌肥相比，生物有机肥包含功能菌和有机质，有机质除了能改良土壤，其本身就是功能菌生活的环境，施入土壤后功能菌容易定殖并发挥作用； 而生物菌肥只含有功能菌， 且其中的功能菌可能不适合有的土壤环境，无法存活或发挥作用。另一方面，生物菌肥价格，生物有机肥比生物菌肥价格更为便宜。

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菌肥亦称生物肥、生物肥料、细jun肥料或接种剂等，但大多数人习惯叫菌肥。确切地说，生物肥料是菌而不是肥，因为它本身并不含有植物生长发育需要的营养元素，而只是含有大量的微生物，在土壤中通过微生物的生命活动，****作物的营养条件。

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