“营改增”将给医yao流通公司带来“苦不堪言”的高税负，也会给医yao行业带来很大影响。据中国物流与采购联合会此前发布的报告，以上市公司九州通[-0.51% 资金 研报]医yao集团为例，九州通集团下属五家企业2013年平均税负率为4.71%，上年同期平均为2.73%。“营改增”后，税负率同比上升了72.74%。并且13508家代理商应该保留2000多家，那么11000多家代理商或将“没有明天”，全国300万医yao代表将面临变革。

“两票制”是指药品从药厂卖到一级经销商开一次票，经销商卖到医院再开一次票。以“两票”替代目前常见的七票、八票，减少流通环节的层层盘剥，并且每个品种的一级经销商不得超过2个。

“两票制”将使得当前“层层加价”的医yao流通企业首先“挨刀”；两票制的作用主要是建立价格追溯机制，尽可能压缩流通中间环节，规范流通秩序。其影响主要表现在，大量底价招商企业被迫转高开佣金制，代理商从商业环节的小循环转变为到生产企业环节的大循环。而生产企业也面临两难选择，继续底价招商则面临被揭底价的招标降价风险；转高开佣金则面临高额的税负，票进项来源困难等问题。因此，在这种环境下，企业应将业务流程与现行的税收政策及相应的纳税筹划方案相结合，在必要时通过业务流程再造改变税收，运用创造性思维设计纳税筹划方案，通过合理、合法的方式，有效规避或减少企业各个经济活动环节中的税负，对企业而言是最行之有效的降低成本的方法。