核酸酶污染的过夜鉴定
所有的限制性内切酶与1μg 底物DNA在50μl反应体系中,采用推荐的NEBuffer温育过夜。比较酶切1小时的特征带型和过夜酶切的带型。如果两种情况下带型均明显、没有改变,则说明测试的酶中不存在非特异性的dna酶。可以温育过夜的*大酶单位数。
核酸外切酶污染鉴定
所有的限制性内切酶与1μg 单双链混合的、3H标记的E.coli DNA在50μl反应体系中,采用随酶提供的NEBuffer,在推荐的温度下温育4小时。通过可溶解的TCA着色,可以计算出反应体系中被标记的DAN的百分比,进而可以显示出核酸外切酶的污染。该种方法可检测出的底线是0.05%。
限制酶分布区域
限制性核酸内切酶分布*广,几乎在所有*的属、种中都发现至少一种限制性内切酶,多者在一属中就有几十种,例如在嗜血杆1菌属中(Haemophilus)现已发现的就有22种。有的菌株含酶量*低,很难分离定性;然而在有的菌株中,酶含量*高.如E. coli的pMB4(EcoRI酶)和H. aegyptius(Hal Ⅲ酶)就是高产酶菌株。据报道从10g的H. aegyptius的细胞中,能分离提纯出可消化l0gλ噬菌体DNA的酶量。*是限制性内切酶,尤其是特异性非常强的I类限制性内切酶的主要来源。
质粒载体和外源DNA中限制酶切位点的性质
如今,质粒载体中限制酶切位点的种类*为繁多,因而通常都有可能找到某种带限制酶切位点恰恰与外源DNA部分片段本身毫无二致的载体。这就具备一个不可1比拟的优点,也应是可以用相应的限制酶消化重组质粒崦回收外源DNA。另一种方案,则是把片段插入到载体中能产生匹配末端的任何位点中。例如,识别不同的六核苷酸的限制酶BamHl和BglⅡ产生具有相同突出末端的限制酶切片段,mRNA切割酶,这样用BglⅡ消化而制备的外源DNA部分片段可以克1隆到用BanHl消化的质粒中。这通常会使接合序列不能被曾用于外源DNA或制备载体的任何一种酶所切开。然而很多清况下,用切点位于多克1隆序列侧翼的限制酶进行消化,可将片段从重组质粒中摘出。偶尔在质粒的以及外源DNA两端的限制酶切位点之间,不可能找到“门当户对”的搭配关系。这时可用下面两种方案加以解决:
1)在线状质粒末端和(或)外源DNA部分片段的末端接上合成在接头或衔接头。
2)在得到控制的反应条件下,用大肠杆1菌DNA聚合酶I Klenow片段部分补平带3凹端的DNA部分片段。如第九章所讨论,这样常可以使那些不相匹配的限制酶切位点转变为互补末端,从而促进载体和外源DNA的连接。因为部分补平的反应消除了同一分子两端彼此配对的能力,故连接反应过程中环化和自身寡聚化的机会也会有所降低