蛋白带偏斜常常是由于滤纸条或电****放置不平行所引起的，或由于加样位置偏斜而引起。

蛋白带过宽，与邻近蛋白泳道的蛋白带相连，这是由于加样量太多或加样孔泄漏引起的。

蛋白带模糊不清和分辨不佳是由于多种原因引起的。虽然梯度凝胶可以****分辨率，但与其他方法相比，常规聚****凝胶电泳是分辨率较低的方法。为了****分辨率，不要加过多的样品，小体积样品可给出窄带。加样后应立即电泳，以****扩散。选择合适的凝胶浓度，使组分得以充分的分离。通常靠近前沿的蛋白带分辨率不佳，所以应根据分子量与凝胶孔径的关系，灌制足够长度的凝胶，以使样品不会走出前沿。样品的蛋白水解作用也引起扩散而使分辨率降低。水解作用通常发生在样品准备的时候，系统中的内源性蛋白酶会水解样品蛋白，如果在缓冲液中加蛋白酶*可以减少这种情况的发生。

电泳（Electrophoresis）是指带电荷的粒子或分子在电场中移动的现象称为电泳。大分子的蛋白质，多肽，病毒粒子，甚至细胞或小分子的氨基酸，核苷等在电场中都可作定向泳动.1937年Tiselius成功地研制了界面电泳仪进行****蛋白电泳，它是在一U型管的自由溶液中进行的，电泳后用光学系统使各种蛋白所形成折光率差别成为曲线图象，将****蛋白分为白蛋白，α1-球蛋白，α2-球蛋白，β-球蛋白和γ-球蛋白五种，随后，Wielamd 和Kanig 等于1948年采用滤纸条做载体，成功地进行了纸上电泳。

生物大分子如蛋白质，核酸，多糖等大多都有阳离子和阴离子基团，称为*离子。常以颗粒分散在溶液中，它们的静电荷取决于介质的H+浓度或与其他大分子的相互作用。在电场中，带电颗粒向阴****或阳****迁移，迁移的方向取决于它们带电的符号，这种迁移现象即所谓电泳。